Personnages Principaux :
Sonic :
Le héros du jeu est un hérisson bleu. Le gameplay est dans la droite lignée des jeux précédents, mais transposé en 3D : détruire les ennemis, récupérer les anneaux et parvenir à la fin du niveau.
Sonic est capable de faire un Spin Dash, c'est-à-dire une course acrobatique dans laquelle le hérisson roule sur lui-même. Qu'il soit arrêté ou en mouvement, le Spin Dash lui permet d'atteindre un vitesse supersonique. Cette capacité lui sert aussi d'attaque. Plus tard, cette attaque sera modifiée pour être encore plus puissante et permettra à Sonic une toute nouvelle capacité .
Tails :
Miles « Tails » Prower, le renard à deux queues, qui n'a pas confiance en lui et qui idolâtre Sonic. Il fait la course contre Sonic et doit finir le niveau avant lui. Pour aller plus vite, il peut voler pour prendre des raccourcis. Il dispose d'un don en mécanique non négligeable et rivalise même avec Robotnik.
Knuckles :
Knuckles the Echidna vit sur une île flottante dans les cieux, du nom de Angel Island. L'énergie nécessaire pour la faire flotter est régie par une gigantesque émeraude, la Master Emerald, dont Knuckles est le gardien. Mais un jour, alors que Robotnik passe juste au-dessus de l'île, Chaos (semblant sortir de l'émeraude elle-même et avoir un lien plus ou moins direct avec l'arrivée de Robotnik) détruit l'émeraude, dont les fragments sont répartis sur l'ensemble du territoire voisin, à la surface de la Terre. Vidée d'énergie, l'île sombre alors dans l'océan, juste à côté de Station Square...
Knuckles est un échidné qui peut planer et s'accrocher aux murs. Il bénéficie aussi d'un « radar naturel » qui lui signale toute présence d'énergie en provenance d'une émeraude du Chaos et même de la Master Emerald.
Amy Rose :
Une hérissonne, amoureuse de Sonic. Le gameplay est similaire à celui de Sonic, mais beaucoup plus lent.
Amy Rose commence lorsqu'elle trouve un petit oiseau abandonné. Elle décide alors de le prendre sous sa protection. Seulement, celui-ci semble être la proie d'un robot maléfique, Zero, qui tentera de s'en emparer durant les niveaux. Elle peut néanmoins neutraliser temporairement ce dernier à l'aide de son marteau fétiche.
Amy réussira à échapper au robot grâce à son désir de sauver le petit oiseau. Elle détruira finalement son adversaire et sauvera, malgré elle, la famille du protégé, qui était prisonnière dans les entrailles du robot.
E-102 Gamma :
Gamma est un robot construit par Robotnik, insensible, mais qui éprouve de plus en plus de sentiments au fil du jeu. Il a été créé à partir d'un oiseau, emprisonné dans ses entrailles. Il fait partie de la série de robots E-100. Il est le deuxième du nom, le premier étant E-101 Bêta, son « frère ».
Gamma fait partie des meilleurs robots que Robotnik ait construit à ce jour. Il reçoit comme mission de s'emparer d'une grenouille du nom de Froggy. Il rencontre ensuite Amy Rose, qui lui fera éprouver pour la première fois des sentiments.
Gamma se révolte ensuite contre son créateur et entreprend d'éliminer tous les robots de la même série que lui, afin de libérer les animaux emprisonnés... Une fois sa tâche accomplie, Gamma s'autodétruira...
Big the Cat:
Big the Cat est un chat énorme qui a l'habitude de pêcher, mais il doit tenter de retrouver son ami Froggy, une grenouille. Big commence son aventure lorsque Froggy devient étrange. Une queue lui est apparue et il lui prend tout à coup l'envie de se sauver.
Big devra partir à la recherche de Froggy dans quelques niveaux où il faut pêcher la grenouille. Il finit par retrouver Froggy à bord du vaisseau de Robotnik. Celui-ci s'avère avoir été possédé par un membre organique de Chaos.
Super Sonic :
Super Sonic est un personnage accessible après avoir fini les 6 aventures principales. Sonic devient « doré » et encore plus rapide ; il doit battre le boss final, Perfect Chaos, un monstre d'une taille gigantesque constitué d'eau.
Super Sonic réussit à nourrir Chaos au fur et à mesure de l'histoire avec chacune des émeraudes dont il s'empare. Hélas, après absorption de la dernière émeraude, le monstre alors nommé Perfect Chaos devient complètement incontrôlable. Robotnik tente de s'en débarrasser avec son puissant vaisseau de guerre l'« Egg Carrier 2 », en vain.
Alors que tout le monde semble découragé, Tikal intervient. Elle suggère alors à Sonic d'utiliser la force des 7 émeraudes du chaos pour une ultime tentative d'attaque contre Perfect Chaos. Le héros se transforme donc, grâce aux émeraudes, en Super Sonic.
Personnages secondaires :
Dr Robotnik ou Dr Eggman :
Le Dr Robotnik (surnommé Eggman (tête d'œuf) par Sonic) est un génie dont le QI atteint 300. Il décide dans cet opus d'utiliser la puissance de Chaos afin de nourrir ses ambitions de conquête du monde. Hélas, sa brillante idée échoue lamentablement lorsque le monstre devient incontrôlable et surpuissant, laissant une fois de plus l'avenir du monde entre les mains du hérisson bleu.
Chaos :
Chaos, un monstre mythologique de constitution liquide, a été créé pour protéger la Master Emerald, les 7 Émeraudes du Chaos et de petites créatures fragiles nommées chao. Mais lorsque la tribu de Tikal voulut s'emparer des 7 émeraudes, Chaos les absorba et devint surpuissant. Son cœur se remplit de colère et de tristesse en voyant les chaos piétinés par les soldats de la tribu et Tikal dut l'enfermer avec son âme dans la Master Emerald.
Des milliers d'années plus tard, Eggman libéra Chaos et, involontairement, l'âme de Tikal, dans le but de dominer le monde.
Formes Diverses :
* Chaos 0 : Première forme de Chaos, c'est le premier boss du jeu dont Sonic se débarrasse aisément.
* Chaos 1 : Forme de Chaos après avoir absorbé une Chaos Emerald. Il devient plus grand et quelques os se forment à son bras droit, à l'endroit où l'émeraude est absorbée. Aucun personnage n'affronte cette forme.
* Chaos 2 : Forme de Chaos après avoir absorbé une deuxième Chaos Emerald. Les os de son bras droit se propagent sur ses 2 bras, il est plus grand, sa tête est plus penchée vers l'avant et les cornes sur sa tête changent de place, lui donnant une allure de requin-marteau. Il a aussi gagné des capacités comme un bouclier d'énergie bleue pour contrer les attaques frontales et une habilité à se transformer en une énorme boule bleue, plusieurs petites orbes ou des vagues d'eau. Knuckles l'affronte dans un hôtel de Station Square ; Sonic et Tails le rencontrent juste avant sa transformation en Chaos 4. Les deux émeraudes en sa possession sont situés dans son bras droit et son bras gauche.
* Chaos 3 et 5 : Formes jamais montrées dans la mesure ou Chaos 2 et 4 absorbent deux émeraudes en même temps, sautant les étapes de Chaos 3 et 5.
* Chaos 4 : Chaos change considérablement, il a maintenant la forme d'un énorme requin. Ses nouveaux pouvoirs sont des vagues de feu, la capacité à nager à une très grande vitesse, à créer des explosions d'eau et à se transformer en 4 petites orbes bondissant droit sur le joueur. Il affronte Sonic, Tails et Knuckles mais se fait battre. Les Chaos Emerald 3 et 4 se situent dans son abdomen.
* Chaos 6 : Chaos devient une sorte de gigantesque scorpion. Il a 8 yeux(voire plus)et des dents semblables à des rasoirs. Contrairement à ses autres formes, son cerveau s'étant déplacé trop profondément dans son corps pour pouvoir être atteint, il ne peut être blessé qu'en le congelant puis en le frappant. Sonic et Knuckles affrontent tout les deux Chaos 6. Ses nouvelles techniques sont de grandes ondes de chocs et la capacité d'absorber ses ennemis. Il peut aussi créer des piques sortant de son corps et frapper l'ennemi avec son énorme queue. Les Chaos Emerald absorbées sont disposées un peu partout dans son corps.
* Perfect Chaos : Forme Finale que prend Chaos après avoir absorbé les pouvoirs négatifs des Chaos Emeralds. Chaos devient un dieu de la destruction, il ressemble à un énorme serpent, sa bouche se prolonge et ses yeux ressemblent à ceux d'un reptile. La base de son corps ressemble à un énorme cyclone et de longs tentacules se situent à la base de son corps. Les pouvoirs de Perfect Chaos incluent la création de petites tornades, de boules de feu roses et jaunes et d'un énorme rayon d'énergie sortant de sa bouche.
Tikal :
Fille de Pachacamac, le chef de la tribu d'échidnés dont elle fait partie (et dont Knuckles est le dernier survivant), Tikal essaya de raisonner son père qui voulait s'emparer des 7 émeraudes du Chaos pour « le bien de la tribu » mais échoua.
C'est elle qui s'est enfermée avec Chaos dans la Master Emerald pour éviter qu'il ne détruise le monde. Elle veille sur les chaos et la Master Emerald. Elle a compris que les 7 émeraudes du Chaos sont les serviteurs de la Master Emerald, comme il est précisé dans la prière aux émeraudes.
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